Wenn Du weißt, wie lange Du die Protokolle aufbewahren mußt und weißt, wie lange die Lebensdauer Deines Speichermediums ist (auch CDs haben keine unendliche Lebensdauer) und Du sicherstellen kannst, dass Du das Medium am Ende der Aufbewahrunsgfrist noch unmanipulierbar lesen kannst (auch welchem Computer), spricht nichts dagegen, das Papier zu vernichten.
Gruß
Harald